Сравнение диагностических панелей по составу

Где какие маркеры?

Мы заметили, что разные научные группы во многом пересекаются в своём видении диагностики старения. Некоторые маркеры входят почти во все панели. Давайте внимательнее посмотрим на составы этих списков.
26 ноября 2019

Наши проекты

/
Виртуальный НИИ
/
Диагностика старения: аналитика
/
Сравнение диагностических панелей по составу

Эпигенетические часы

История с эпигенетическими биомаркерами началась в 2013 году. Тогда первопроходец в этом направлении, специалист в области генетики и биостатистики, сотрудник Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе Стив Хорват (он как раз на фото) представил свой новый революционный метод определения биологического возраста, названный «эпигенетическими часами». Как можно понять из названия, в основе этого метода лежали изменения эпигенома, а именно метилирование ДНК.

Сейчас известно как минимум три вида таких часов: часы Хорвата, часы Ханнума и DNAm PhenoAge.

Читать наш обзор

Индекс дряхлости (Frailty Index)

Сам термин «frailty» был введён в научный оборот J.H. Friend в далёком 1954 году, впервые прозвучав в статье Science "Alas for Human Frailties!". Само понятие frailty сегодня определяется как наличие у пожилого человека таких признаков: потеря веса (саркопения), доказанное динамометрически снижение силы кисти, выраженная слабость и повышенная утомляемость, снижение скорости передвижения, значительное снижение физической активности. Принято считать, что frailty (старческая астения) имеет место при наличии трех и более симптомов, если же симптомов один или два — то это старческая преастения.

В конце июля 2018 года вышло большое исследование международной группы исследователей, посвящённое поиску эффективных биомаркеров старения в рамках концепции frailty (хрупкости, или старческой астении).

Читать наш обзор (1 часть)

SASP

"Ассоциированный с клеточным старением секреторный фенотип" (senescence associated secretory phenotype, SASP). Термин SASP был введён в 2008 году Джуди Кампизи и соавторами.

Все факторы SASP по молекулярным механизмам действия можно разделить на 3 большие группы: связывающиеся с рецепторами (например, растворимые сигнальные молекулы), прямого действия (в основном, это молекулы, разрушающие межклеточный матрикс, такие, как ММП) и регуляторные (ингибиторы факторов из первой и второй группы).

Читать статью

Сингапурская панель

6 августе 2018 г. Опубликовано исследование в журнале The Journals of Gerontology статья «Биомаркеры, прогнозирующие смерть от всех причин в течении 10 лет».

Было проведено исследование по определению эффективных биомаркеров, связанных с общей смертностью от всех причин. В качестве основы был рассмотрен широкий спектр аналитов, связанных с шестью основными физиологическими функциями:

Цитокины, хемокины и факторы роста;
Регуляторы метаболизма глюкозы и адипокинов;
Молекулы адгезии;
Ответ острой фазы (воспаление);
Патоген-специфические антитела;
Ремоделирование костной ткани.

Читать наш обзор

Китайская панель

"Старение представляет из себя зависящий от времени физиологический функциональный спад, который поражает большинство живых организмов. И этот процесс напрямую связан с молекулярными изменениями. Он также является самым основным фактором риска для многих неинфекционных заболеваний. С одной стороны, выявление биомаркеров старения будет способствовать дифференциации людей, имеющих один и тот же хронологический возраст, но разные варианты старения. Количественные биомаркеры старения также могут составить группу измерений для «здорового старения» и, кроме этого, прогнозировать продолжительность жизни."

Мы перевели статью о биомаркерах старения китайских учёных.

Читать перевод

Британская панель

Команда британских геронтологов из университетов Кембриджа, Бирмингема, Эдинбурга и Ньюкасла провела исследование, по результатам которого была составлена панель биомаркеров здорового старения.

Выразим со своей стороны несогласие с термином «здоровое старение», так как это оксюморон, старение – это потеря здоровья, нездоровое явление само по себе. Но тем не менее термин такой существует и мы рассмотрим и этот подход, опираясь на мнение авторов статьи.

Исследования по здоровому старению включают в себя:

Биологические процессы, способствующие старению;
Социально-экономические и экологические воздействия на всю жизнь, которые модулируют старение и риск возрастной нестабильности, инвалидности и болезней;
Различные вмешательств, которые могут влиять на траекторию старения.

Читать наш обзор

SENS

Совместный проект SENS и Open Longevity.

Концепция SENS (Strategies for Engineered Negligible Senescence, стратегии достижения пренебрежимого старения инженерными методами) была предложена британским геронтологом Обри ди Греем. Идея концепции — это необходимость развития и применения технологий для борьбы со старением и возраст-зависимыми заболеваниями для «починки» накапливающихся повреждений в организме. Цель нашего обзора потенциальных биомаркеров состоит в том, чтобы создать панель SENS-диагностики старения.

Пока мы предложили и описали маркеры, связанные с:

Читать про SENS

Диагностические панели с международной репутацией

Те самые, обоснования которых опубликованы в международных рецензируемых научных журналах.

Часы Хорвата (IEAA);CpG сайты метиллирования ДНК;353 сайта;Стив Хорват;2013;Ссылка link=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24138928 Часы Ханнума;CpG сайты метиллирования ДНК;71 сайт;Грегори Ханнум и соавторы;2013;Ссылка link=https://medschool.ucsd.edu/som/medicine/research/labs/ideker/publications/Documents/Hannum_MolCell_2012.pdf DNAm PhenoAge;Показатели крови;9 маркеров;Стив Хорват;2018;— Frailty Index;"Анализы", то есть метаболические маркеры из физиологических жидкостей;44 (19 приоритетных и 22 дополнительных);Cardoso AL с соавторами;2018;Ссылка link=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30071357 SASP;"Анализы", но большинство довольно редкие;Более 40 маркеров;Термин предложила Джуди Кампизи с соавторами;2008;Ссылка link=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19053174 Сингапурская панель;"Анализы", в основном доступные;18 маркеров;Yanxia Lu с соавторами;2018;Ссылка link=https://academic.oup.com/biomedgerontology/article-abstract/74/4/469/5066757 Китайская панель;"Обычные анализы" плюс SASP, длина теломер, эпигенетика, циркулирующие микроРНК и пр., плюс ИМТ и обхват талии, физиогномика и физические функции;Более 80 маркеров;Xian Xia с соавторами;2017;Ссылка link=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5473407/ Британская панель;"Обычные анализы" плюс длина теломер, антропометрия, физические и когнитивные функции;около 50 маркеров;Хосе Лара с соавторами;2015;Ссылка link=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4572626/

SENS диагностика

Совместный проект SENS и Open Longevity. Авторы: Алексей Ржешевский, Денис Одиноков.

Более подробно состав панелей и их сравнение можно посмотреть в этой таблице. Открыт доступ к комментированию.

Google Sheets

Присоединяйтесь к обсуждению