We process personal information and data on users of our website, through the use of cookies and other technologies, to deliver our services, personalize advertising, and to analyze website activity. We may share certain information on our users with our advertising and analytics partners. For additional details, please refer to our Privacy Policy.


By clicking “AGREE” below, you agree to our Terms of Use and Privacy Policy , as well as our personal data processing and cookie practices as described therein. You also consent to the transfer of your data to our servers in the United States, where data protection laws may be different from those in your country.

Наши новости
Open Genes

Не новость даже, а напоминание

Расскажу о своей боли. Если я подойду к инвестору и скажу, смотри, какой интересный ген, связанный со старением — SIG (супер важный ген, я его только что придумал, ну или переназвал IGF1).

Воздействуя на него плюс еще на один, мы можем попытаться увеличить продолжительность жизни. А еще SIG тесно связан вот с таким редким (орфанным) заболеванием, и мы пойдем против него в клинические исследования, чтобы получить ускоренную процедуру рассмотрения. Кстати, я тут синтезировал несколько молекул, и они показали биологическую активность, вполне себе ингибируют соответствующий белок (может быть, даже продление жизни показал на животных, если у меня было несколько сотен тысяч долларов).

Публикация в хорошем журнале — и дальше получить несколько миллионов долларов вполне реально.

Но! Так и без меня все поступают. На каждом этапе по множеству генов, связанных со старением, работают десятки биотех стартапов.

У меня другое предложение на самом деле. Давайте посмотрим на все гены, связанные со старением и продолжительностью жизни, и опишем всё, что знаем про них. Чтобы мы могли как-то разбивать их на группы, классифицировать и подбирать коктейли препаратов, глядя на картину целиком.

Я не знаю, будет ли из этого толк, но понять это возможно только, если провести эту работу. Минимальный результат у нас будет такой: информационно-образовательный проект про гены, связанные со старением и долголетием.

При этом я считаю, что нельзя создать диагностику старения, не рассмотрев изменения работы всех генов, существенно связанных со старением и продолжительностью жизни.
На такой проект я не могу найти и тридцати тысяч долларов, а надо сто. У нас он уже сделан на 10%, но движется крайне медленно. Что можно предпринять здесь ещё, я пока ума не приложу. Вот сам проект. Мне кажется, он очень красивый
https://open-genes.com

О других базах данных по теме мы, конечно, знаем, и на сайте указано, что нас в них не устраивает.

Что я буду делать? Я продолжу рассказывать о генах, ассоциированных со старением и долголетием, и буду это делать до тех пор, пока не найду людей и деньги, чтобы реализовать идею систематизации всей информации. При этом сама идея — она гораздо более масштабная, и надо описать всё старение в несколько десятках датасетах. Просто это самая простая база данных, которую можно создать.

Итак, поехали.

Из того, что мы на сегодня знаем о старении, репарация ДНК выступает одним из ключевых факторов.

Геномная нестабильность — один из 9 классических признаков старения, описанных в 2013 году С. Lepez-Otin с коллегами в самой знаменитой статье о старении.
В течении всей жизни организма ДНК подвергается постоянным атакам, таких как активные формы кислорода (АФК), ошибки репликации и токсические химические вещества. Чтобы противодействовать вредным эффектам ДНК-повреждающих агентов, в ходе эволюции возникли универсальные механизмы репарации ДНК.

Но механизм репарации ДНК далеко не совершенен. Со временем происходит накоплению не восстановленных повреждений ДНК, мутаций и геномных перестроек. Которые, в свою очередь, могут способствовать старению и раку.

Мало того, эффективность репарации ДНК снижается с возрастом, сопровождаясь более быстрым накоплением мутаций.

Поэтому было бы логично предположить, что долгоживущие организмы должны обладать более эффективными механизмами, защищающими геном от повреждений. В разное время разные команды показывали качественную репарацию ДНК, как отличительную черту долгоживущих видов.


Так, было показано, что распознавание двунитевых разрывов ДНК коррелирует с видовой продолжительностью жизни.

Уровень одного из белков, Ku80, который входит в состав комплекса, действующего как усилитель сигнала повреждения ДНК, был гораздо выше у долгоживущих, чем у короткоживущих видов.

Сравнение транскриптомов печени мышей, голых землекопов и людей показало, что долгоживущие виды (голый землекоп и человек) имеют повышенную активность генов, связанных с репарацией ДНК по сравнению с короткоживущими видами (мышами).

В другом исследовании Вадим Гладышев с коллегами провели транскриптомический анализ фибробластов 16 видов млекопитающих. Полученные результаты показали, что экспрессия генов, связанных с репарацией ДНК (таких как Msh6, Pms2, Pnkp, Ercc1, C17orf70, Fancg) и защитой теломер (Rif1, Terf1, Tinf2) положительно коррелировала с видовой продолжительностью жизни.

Примечательно, что кроме этого клетки долгоживущих видов имели повышенную активность генов, участвующихв метаболизме глюкозы. И напротив — пониженную активность генов, участвующих в протеолизе, аутофагии (Ube2b, Ube2v1, Rad18, Mycbp2, Sumo3, Ufm1, Rnf2, Rnf6, Rnf14, Rfwd2, Fbxl17, Fbxl20, Fbxo18, Fbxw2, Atg4a, Atg7 и Atg10) и транспорте/локализации белков (Sec22a, Sec31a, Sec62, Golt1b, Timm8a1, Tomm6, Ipo4 и Kpna4).

А также показали высокие уровни аминокислот и низкие уровни лизофосфатидилхолина и лизофосфатидилэтаноламина.

Дополнительно, ещё ряд генов, участвующих в репарации ДНК и связанных с долголетием, были описаны Вадимом Гладышевым и его коллегами в транскриптомном исследовании печени, почек и мозга у 33 видов млекопитающих.

Я привел примеры исследований, которые нам надо осмыслить, собрать все вместе и проанализировать. Например, когда эти гены возникли в эволюции? Какие ещё функции выполняют? С какими заболеваниями связаны? И так далее. Собственно, для этого мы и создаем Open Genes.
comments powered by HyperComments